Trump yönetimi ile Harvard Üniversitesi arasındaki anlaşmazlığın ardındaki neden, Beyaz Saray'a bağlı bir görev gücünün üniversite yönetimine gönderdiği izinsiz bir mektup oldu. New York Times'a konuşan yetkililer, mektubun 11 Nisan'da Antisemitizmle Mücadele Görev Gücü tarafından gönderildiğini ve bu durumun, iki taraf arasındaki gerilimi tırmandıran bir faktör olduğunu belirtti. Mektup, üniversitede 'reform' taleplerini içeriyordu ve bu durum, Trump yönetimi ile Harvard arasında daha önce ortaya çıkan anlaşmazlıkları daha da derinleştirdi.
Mektubun gönderimi konusunda Beyaz Saray içinde de görüş ayrılıkları yaşandığı ortaya çıktı. Bazı yetkililer mektubun erken gönderildiğini, bazıları ise mektubun sadece görev gücü içinde paylaşılması gerektiğini savunuyordu. Bu durum, Trump yönetiminin Harvard'a karşı uyguladığı baskının yönetim içindeki farklı yaklaşımları da yansıttığını gösteriyor. Mektubun ardından yapılan görüşmelerde, Harvard yetkililerinin mektubun 'hata' sonucu gönderildiğine ikna olduğu bilgisi de paylaşıldı.
Anlaşmazlık, Trump yönetiminin Harvard'a yönelik federal fonları dondurma tehdidiyle başlamıştı. Yönetim, üniversitedeki Filistin destekçisi protestolar ve çeşitlilik programlarını gerekçe göstererek, 8,7 milyar dolarlık hibelerin 'sivil haklar yasalarına uygunluğunu' soruşturacağını duyurmuştu. Harvard'ın bu talepleri reddetmesi ve federal fonların dondurulmasına karşı dava açmasıyla kriz tırmanmış, Beyaz Saray da fonları 'antisemitizmle ilgili yasaların' uygulanması gerekçesiyle savunmuştu. Bu durum, iki taraf arasındaki gerginliğin daha da artmasına neden oldu.
